1.继发性肝癌肝外癌灶转移至肝者，一般病情发展较缓慢，症状较轻，AFP检测除少数原发癌在消化道的病例可呈阳性外，一般为阴性。但确诊的关键仍在于病理检查和找到肝外原发癌的证据。
2.肝硬化原发性肝癌多发生在肝硬化的基础上，故二者的鉴别常有困难。若肝硬化病例有明显的肝大、质硬的大结节，或肝萎缩变形而影像检查又发现占位性病变，肝癌的可能性很大。
3.活动性肝病(急性肝炎、慢性肝炎)肝病活动时血清AFP往往呈短期升高，应定期多次测定血清AFP和ALT进行分析:①AFP和ALT动态曲线平行或同步升高，或ALT持续增高至正常的数倍者，则活动性肝病的可能性大；②二者曲线分离，AFP升高而ALT正常或由高降低者，则多考虑原发性肝癌。
4.肝脓肿一般有明显的炎症表现，肿大的肝脏表面平滑无结节，触痛明显，白细胞计数升高，超声检查可探得肝内液性暗区。
5.肝非癌性占位性病变肝血管瘤、多囊肝、包虫病等可用CT、放射性核素血池扫描、MRI、超声检查帮助诊断。
原发性肝癌是指发生在肝细胞或肝内胆管细胞的恶性肿瘤，继发性肝癌是指身体其他部位的恶性肿瘤转移至肝脏，其实两种都较为严重毕竟都是恶性肿瘤
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